神奇寶貝・道具出現時期
| 出現時期 | 神奇寶貝 | 道具 |
| 一開始 | 飄飄球、青綿鳥、食夢夢、 象徵鳥、利歐路 |
紅色碎片、藍色碎片、黃色碎片、綠色碎片、 ＰＰ增加劑、元氣碎片、紅蘋果 |
| 捕獲龍捲雲後 | 壺壺、寶寶丁 | 元氣塊、太陽之石、月之石 |
| 捕獲雷電雲後 | 海星星、銅鏡怪、3D龍、 拉魯拉絲 |
火之石、水之石、雷之石、葉之石 |
| ED後 | 迷唇娃、花岩怪、洛托姆、 波克比 |
聖灰、神奇糖果 |
| 特殊(通關前可)※1 | 鐵啞鈴、呆呆獸、咕咕 | |
| 特殊(需通關)※2 | 帝牙盧卡、帕路奇犽、 騎拉帝納、鳳王、洛奇亞 |
※1詳細請參考特殊零件取得與密碼
※2主機需插入對應遊戲片，詳細同樣參考上面的連結
通關後出現關卡(僅可獲得道具)
| 名稱 |
出現道具 |
| シミュレーターα | 星之碎片、心之鱗片、ＰＰ增加劑、元氣塊、神奇糖果、生命之玉 |
| シミュレーターβ | 星之碎片、心之鱗片、神奇糖果、覺醒石、王者之證、氣合絲帶 |
| シミュレーターγ | 星之碎片、心之鱗片、神奇糖果、生命之玉、氣合絲帶、進化奇蹟 |
