本作的登場人物多數都具有不可思議的能力。他們可大致分為超人、魔物使兩個系統，這兩大派閥自先史時代就處於敵對關係。然而他們的能力起源都相同，即皆為孕育萬物的奇跡之力——AURORA之體現。AURORA即為生命力。是宿於一切生命根底的奇跡（在本作的世界中，生命存在於此 = 奇跡）之力。
超人也被稱為狩獵者。他們中的大半都屬於一個名為Guardian的組織。即使其本人不願意，只要作為超人的能力開花結果，就立刻會被組織找到並拘押。這是由於超人的存在不可為世人所皆知的緣故。
超人具有兩大特色。其一是全體共通的強大肉體。肌肉力量、生命力、敏捷、敏銳的五感、社交能力。超人中的多數都具有此類肉體方面的強大。雖然有個體差異，但他們普遍具備一般成年男性數倍至數十倍的力量。這種身體方面的強度，為超人們在軍事方面的強大提供了有力保障。其二便是固有能力。這是一種類似必殺技的力量，根據各人的資質，可分為狩獵、採伐、污染三者中的某一系統。然而在現代，槍炮火器的威力往往凌駕於此類能力，故可用於實戰的能力並不多。為了將來本作可能變成超超有趣的SRPG考慮，下面將對超人的三大屬性進行一些補記。
不論超人還是魔物使，能力都不是與生俱來。能力是以資質的形式被發現。外向且自我本位的人成為超人，而內向且對周遭有所不滿的人作為魔物使的力量覺醒的情況是非常常見的。或許很容易讓人以為前者正義而後者邪惡，但其實兩者各有長短。超人們雖然積極卻有著自以為是的傾向，反之魔物使雖然容易自閉卻能聽從他人的指示。這些包含了性格方面的資質，最容易在青春期前後被認知到。因此能力的開花也多見於同一時期。在這個時期，有些人在社團活動中一鳴驚人創下紀錄，有些人則覺醒了操縱人偶的超能力。此類小小的異變終究必會被Gaia或Guardian察覺，然後他們便會實施接觸。“你的力量無法在社會中得到發揮。唯一的辦法就是隸屬於我們組織。”像這樣，姑且算是採取交涉的方式，但實際上能力者自身並沒有決定權。假如拒絕，往往會被施以殘酷的記憶處置，或受到長期監視，抑或遭到飛來橫禍而死。不論是Gaia還是Guardian，都利用其力量干涉著歷史的進程。由於雙方都有不少非合法的行為，所以被世人得知存在對雙方而言都將會非常困擾。對知曉了UFO秘密的人會有身穿黑衣的男子（Man in Black）前來發出警告，這個都市傳說也許意外地是從兩大組織這裡發源的。
2、Guardian與Gaia
2-1 關於Guardian
Guardian的特徵是高度的組織化。他們對外展開各種經濟活動作為掩飾。特別是與軍需產業關聯甚緊，對世界經濟的影響力也不可小覷。然而另一面其組織內部的對立也很常見，因而抱有成員間互扯後腿的問題常態化的苦惱……就是這樣一個組織。本來他們擁有成為地球最強戰力的實力，卻天生地無法被統合到一起。雖然上層部是這樣，但每名成員本身還是相當優秀的。之前也提及作為超人的資質開花的人幾乎全都被置於Guardian的監視之下，在這方面體現的調查、諜報能力的確是非常傑出。Guardian中，大致上分為兩大命令系統（勢力範圍）。在南歐紮根已久的「特別教區」系，以及伴隨著經濟活動的繁榮發言力得以增大的環太平洋「全人會議」系。前者以宗教為中心，而後者則更重視近現代的合理化思潮。當然，這兩個勢力之間的關係並不算好。但這僅限於上層幹部之間的關係，優秀的現場指揮官們則為保持成員間步調一致費盡心血。所謂「特別教區」，指的就是「那個」國家。某世界最小國家。假如將Gaia的魔物視為惡魔、惡靈，那麼將之打倒的Guardian被推崇為英雄、聖人也就不足為奇了。不過在現代，Guardian部門成為了被掩蓋的存在。「全人會議」方強在海運及兵器產業，是基於此類商業活動而崛起的新潮流。通過民間軍事服務等對發展中國家實行軍事介入，與邪惡的魔物使們交戰。雖然名義上是邪惡的魔物使，其實他們多半只是被獨裁者之類的人所利用，但這些情況並無所謂。進一步考慮得複雜一些的話，對發展中國家進行軍事介入也與部分發達國家的政治意圖相符，因而也能籍此獲取各種便利。真令人討厭呢。作中時不時地也有關於此類派閥鬥爭存在的描述，有興趣的讀者可以試著去尋找一下。順帶一提非基督教文化圈的日本處於「全人會議」的影響下。像江坂宗源等人就是接受「會議」方指示的現場指揮官。
2-2 關於Gaia
Gaia也有著名為Mater會的世界規模的母體組織。名稱是“Magna Mater”（在日本國內就是日本Mater會），主要進行環保活動（甚至還有官方主頁）。Mater原本是宗教團體（宗教結社）。由於過去長期遭受鎮壓的歷史，他們至今仍與國家權力保持一定距離。Gaia並沒有將所有魔物使都置於監視下的統率能力，有相當多魔物使成了漏網之魚。由於魔物使們對世界有所不滿，從某種意義上可說是一群乖僻者的集團，因此有著只接受主動請求加入者的傾向。既然如此還不如乾脆謀殺掉比較省事，他們有時也會下達諸如此類的判斷。而世間UMA傳說相比超人傳說更常見的緣故或許就在此。同樣是魔物使，既有為組織工作者，也有終其一生未能知曉組織存在者。力量為當權者濫用，或抱著自己真的召喚出惡魔的誤解而死的也大有人在。魔物使的技術，很容易與自古以來的圖騰崇拜、泛靈論及土著信仰等建立關聯，因此以發展中國家為中心，應該存在著相當數量的與Gaia並無瓜葛的魔物使。
3、關於篝，以及MOON篇
3-1 被稱為鑰匙的少女的職能與目的
被稱為鑰匙的少女・篝，是地球所生出的類似使者的存在。她的職能是確認智慧生命體是否具備成為散佈體的條件。所謂散佈體，是指植物在繁殖時散佈種子的機能。舉例來說就是鳳仙花或蒲公英之類。也就是說，人類的存在對於行星而言就是散佈體。起初種子附著於行星上，從種子內流出的AURORA與資源結合得以增殖，最終覆蓋整個星球。由於AURORA是生命產生的原動力，因此之後只需等待自然進化的開始即可。行星存在著像這樣的近乎本能的靈魂，可以稱之為星靈。就像蒲公英散佈自己的種子，星靈也通過某種東西在宇宙中繁殖。這某種東西，就是人類（智慧生命體）。智慧生命體的存在意義，就是發展科學技術，探索其他適於移民的行星。在廣闊的宇宙中，胡亂散佈的種子沒有可能恰好抵達合適的行星。因此，如果不是籍望遠鏡之類的裝置事先正確地把握目的地所在，不會輕易送出種子。這是由於能量的損耗在冰冷的宇宙中是致命的。為了調查智慧生命體，篝具有高度的理解力。篝除了視覺、聽覺以外，還有能夠解讀電磁波的能力。通過綜合的學習，極快地發展自身的理解力。像這樣通覽人類的歷史，以確定作為進化的結果的智慧生命體是否具有實現星靈繁殖的能力。所謂「美好記憶」，指的就是像那樣的「開拓的意志」。如今，在現實社會中宇宙開拓也成了古老的夢想。大家都瞧不起宇宙開拓。整體的潮流就是比起宇宙開拓還不如重視生態主義，通過合理使用有限的能源以實現延命。現實中這樣或許就足夠了。但在本作的世界中，環境設定為如果繼續封閉下去最終將走進死胡同。作中的人們最終沒有達成科學技術上的突破，而是以其他手段為宇宙移民做好了準備，就是在這樣的大環境下迎來了故事的結局。
3-2 星靈的繁殖與進化的過程
星靈的繁殖，是通過產生了生命的星球的殘片附著到未開發行星上而進行的。首先可以想到的，就是破碎的行星的碎片或向宇宙發射的物體（以人類來說的話就比如探測衛星之類）漂流到了行星上。其次雖然可能性比較低，但在古代有外星人乘坐太空船光臨也是一種方法。瑚太朗就醉心於這種方法。
說到底星靈到底是何時誕生的呢。當然，那是早在地球生命誕生之前，也就是46億年之前的事情。宇宙的年齡大約是137億歲。考慮到進化要用46億年，很難想像其已經繁殖了許多代。那麼難道地球是生命特別難以產生的星球嗎？應該是部分的原因吧。進化是否失敗了多次？應該也有這樣的背景吧。只是，採用前述的散佈方法，在星間移動方面從物理上說常常要花費數億年，考慮宇宙的年齡，可以說是很漫長了。所以在此可提出這樣一種說法：「星靈是在宇宙初期的超高壓、超高溫環境下，以非物質的（靈的）存在形式誕生的」。
那麼這種靈的存在能以何種方式進行移動？或許它無法移動。就算可以，恐怕也是非常遲鈍吧。世界仍狹小的時候或許無所謂，但那之後宇宙開始急速膨脹，於是原始星靈便開始焦急了。靈的存在不會死亡，因為沒有肉體。不過，由於某種原因，星靈向擁有肉體的方向進化了。宇宙的溫度開始下降，各種各樣的物質開始產生之後，星靈便與它們結合。這樣一來即使不特意進行宇宙旅行，也可以借擴散的物質將自己送至其他區域。而作為代價，星靈也成為了當物質耗盡時便會死亡的存在……這是為什麼呢。原因搞不好令人意外地是「因為感到了寂寞」吧。
從這些情況看，宇宙中也許會有很多星靈的子孫也不一定。Terra篇ED之後的人類會如此預測吧。
3-3 MOON篇所描繪的世界
Moon的舞臺，是枝葉世界（包含個別路線在內的一切可能性的世界）所發生的事象，象徵性地投影而成的世界。也就是影子。本來倒映在水面的月亮僅僅只是光反射，即使去攪亂它也不會對真實的月亮產生影響，但Moon則與本體具有因果律上的聯繫，是具有回溯性的影子。也就是說「世界分化為枝葉世界（庭之世界），以此實現對可連接到未來的微小可能性進行檢索」這件事，以瑚太朗等超自研成員們齊聚一堂共同戰鬥這一本不可能實現的展開的形式體現了出來。
然而枝葉世界與Moon中何者才是主從關係中的主，這點誰也不清楚。Moon中的瑚太朗當時假如大意的話，或許實際會導致世界的毀滅。此外，還有為什麼會產生影子的問題。這是由於充斥著AURORA的世界會在時空等級放射出光輝。順帶一提，以作者的意圖而言，Moon也是按自己的想法進行了再解釋的《CLANNAD》的「幻想世界」。
3-4 庭之文明是什麼
「庭之文明」是在狹窄的範圍內充滿大量AURORA的狀態下發生的進化形態之一。簡單說，就是奇跡濃度過高的文明。在這樣的世界中，即便在本來無法產生生命的嚴酷環境下，進化也會發生。月文明的複製對象是曾經一度毀滅的地球文明。那是遊戲開場前發生的事情所以作中很少觸及，在那裡也人類也經歷了誕生、進化，然而卻沒能積累足夠的「美好記憶」最終迎來了毀滅。本來地球的可能性將就此斷絕而滅亡，但月球吸取了剩餘的AURORA，所以以月球表面為舞臺發生了地球文明的再現。這就是庭之文明。
在月球上的再進化是以高效率進行的。因此這次AURORA濃度反而會逐漸地升高。本來，世界將走上的道路（可能性）只有一條即主幹世界，但這條主幹由於AURORA的影響發生了細微的震盪，使得各個枝葉世界得以成立。快速地舞動棍棒會看到殘影。但殘影並非幻覺，它們全都是實際棍棒的形態之一。同樣的，各個女主角的路線，即本作的世界雖然也有著路線之間的分歧，但都是在月球上實際發生的事象。如果只當作模擬實驗的話，女主角們確實成為了通向Terra的墊腳石。製作時的方針就是要回避這點而重視世界間的平行關係。以一部遊戲而言，在尊重個別路線的同時，也必須要有一條令至今為止成為了犧牲的角色們獲得幸福的路線。結果，Terra篇就是處於另一個平行世界的位置來進行描寫的。將本作的個別路線、Moon篇、Terra篇三篇合併起來看的話，在地球上展開的故事就僅有Terra篇。
Q&A
Q：小鳥路線中，篝露出那個笑容的理由是什麼？
A：離巢或離親（弑親）現象，對於篝而言是最小單位的開拓精神。
Q：在月球上再現地球？面積差異之類的矛盾要如何解決？
A：作中有壓縮空間這個概念，作為觀測主體的人類極少生息的地區（海洋及沙漠的大部分）在資訊方面會被折疊起來。這一技術的應用便是「人工來世」。
Q：加島櫻也太無敵了吧……
A：這是由於枝葉世界的加島櫻們處於同步狀態。並非是一個人的力量。而魔物大軍的出現有時間延遲，是因為即使憑藉加島櫻的力量那也是極限了。
4、故事結尾的意義所在
4-1 Terra篇的由來
本節是禁斷的項目——結局解說。一個寫作者，一般會認為對自己寫的小說或劇本進行解說是一項不解風情、令人害臊的事情。因為總覺得一旦這樣做，就顯得自己好像成了個藝術家似的，感覺很尷尬。而且也會被同業者們背地裡說「那小子好像覺得自己是個藝術家耶（笑）」，這也很叫人難堪。還是當個匠人就好。保持硬派風格就夠了。不過關於結局，Key收到的玩家點評中有1點見解沒有被提到，這確實是田中我的力量不足，所以從承擔責任上說，即使是藝術家也好，且讓我解說一下吧（含淚笑）。
Terra篇基本上是作為回收伏筆的路線，同時也是作為讓所有女主角得到救贖的唯一可能性來描寫的。那麼何謂救贖呢。對此我也考慮了很多。這是個必須加以考慮的部分。舉例而言，死去的女主角重獲新生應該算救贖。但是，我卻找不到將這種情節寫好的頭緒。到底要怎麼才能將其提高至能夠催人淚下的水準，我一直到最後也沒能找到答案。我想法中的唯一的救贖，必須通過身為主角的瑚太朗支付代價的方式來實現。這樣一來雖然會在情感宣洩方面有所削弱，至少能夠維持一定的說服力。實在是進退維谷的困境。如果優先感情，那麼就不得不犧牲合理性。兩者的並存，對於寫作者而言是個遙不可及的夢想。考慮到《Rewrite》刻畫的是世界的衰亡，從這份責任的沉重來講，最終下了不可輕視說服力的判斷。
4-2 瑚太朗所抵達的終點及其意義
在Terra篇，瑚太朗最終失去了一切。他甚至自行拋棄了在個別路線中那般期盼得到的羈絆，就為了「地球的未來」這一難以令人有實感的曖昧之物而戰鬥到了最後。直到最終場景之前，他甚至都無法確信自己的所為是否正確。但在最後的最後，他從篝那裡得到了認同。除此之外別無他物。確實是個相當殘酷而空虛的結局。不過，在Terra篇裡瑚太朗是不被允許得到其他東西的。所謂的代價就是如此。
在尾聲作為魔物復活的瑚太朗失去了以往的記憶。AURORA雖然會留下進化的記錄，卻不會記下人的思念。在程式設計師的世界中有在原始碼裡留下注釋的習慣。也就是將一些與程式執行無關的注釋埋藏在原始碼之中。注釋可以是必要事項的備忘錄，但也有人帶著玩心寫下注釋。這些注釋對程式的動作不會產生任何影響。如果沒有讀者，它們就將永遠被埋藏在那裡。所謂的思念本來應該是如此無力的事物，精神論本就是如此飄渺的希望，在本作中就是如此定義的。在這個世界裡，僅有思念是不足以拯救任何人的。正因為是在奇跡蔓延的世界中，才更要對無法隨心所欲的這份沉重加以刻畫。對於瑚太朗，我希望他不僅僅是帥氣地幹掉壞蛋，而是在那同時也在無言地灑落鮮血。考慮了這些之後，我認為應該可以讓他抵達那樣一個終點。所以女主角們從一切的煩惱中解放，相互之間能夠展開無憂無慮的對話的尾聲具有相當大的價值。那是曾長年追尋著羈絆的人，在捨棄了一切之後才終於匯出的最優解。瑚太朗成為了並非翼人、而是船人這種新的存在，喪失了作為人活下去的權利與記憶。不過，他最後還是得到了幾樣非常有價值的東西。即與包括篝在內的朋友們之間毫無隔閡的關係。他們之間的關係性被改寫了。
Q&A
Q：Terra篇中千早沒有穿著風祭學院制服的理由是什麼？
A：那是便裝。
Q：Terra篇的千早、露西亞度過的是怎樣的幼年時代？
A：由於Guardian解體，所以組織的非人道計畫全部被凍結。過程在這裡無法詳述，但可以肯定她們的幼年時期將不再有什麼煩惱。Terra中女主角們從各自的痛苦中解放是一條鐵則。咲夜由於圓滿達成了使命，因此在Terra中是不存在的。Rewrite能力幾乎就是作弊，故必須付出沉重的代價。
Q：瑚太朗在結局處變成了怎樣的存在？
A：他成為了被稱作「船人」的特別強化了實現移民能力的魔物。也就是移民船，驅動時必要的AURORA將從移民者們身上持續獲取。可不能小看宇宙旅行。這是在Terra篇結尾與篝的肉體融合之後，化為具有強大可能性的大樹才得以獲得的能力。
Q：小鳥『人間型の魔物は私の母親みたいにワガママになる』這一發言的真意是什麼？
A：Terra篇中，魔物使與超人之間的隔離被打破，從而推進了技術的混交。加上Terra篇的少女們接受的是關於如何使用這一奇跡的英才教育，故可認為她們擁有比過去更為優秀的技能。因此讓魔物獲得自我，或許也並非不可能之事。當然這終將引發各種複雜的人權問題，但應該可以等未來再作考慮吧。
Q：「波奇」的外貌是怎樣的？
A：Terra篇的瑚太朗化裝為風祭凡人。由於是利用能力的化裝，所以整個相貌完全改變了。釋放了全部生命力，迎來了自己作為人類生命的終結的瑚太朗，已將過去的形象忘卻，因此可以認為他是以接近凡人的姿態魔物化的。此外，少女們也受到他魔物化時的強烈干擾，而且瑚太朗樹也含有Terra篝的成分，因此印象上應該完全是另一個人。話雖如此，由於多少也留下了一些作為瑚太朗的要素，所以最終可能會被小鳥或朱音察覺。不過，最早察覺到的大概將會是與他並沒有多少因緣的靜流吧。
其他的Q&A
Q：遊戲中，畫面左下顯示的寫著十二支名字的計量器靈感是從何而來？
A：首先是單獨有個「召喚魔物時要有魔方陣的演出」的點子，後來聯繫到使役魔物需要消耗壽命這個設定，最後就變成了那個樣子。關於那個，並非是劇本作者，而是演出負責人的點子勝出了呢。
Q：故事序盤，魔物理香子為什麼會命令瑚太朗將小鳥帶回家？
A：理香子由於是利用人類的遺體製作的魔物，所以在某種程度上可以憑獨自的判斷進行活動。例如走路的姿勢或使用的語言之類，並不需要一一教授。只要做出大體的指示，就能憑藉生前的記憶維持最低限度的日常生活。在這方面，與那些以動物為基礎製成的魔物可利用其相應的本能是同樣的道理。一定時間內小鳥還不回家，理香子就會以獨自的判斷對她的所在地進行確認。這是其本身具有的屬性。開頭的情況，是她雖然明白小鳥在森林裡，但由於明顯不可能憑一己之力找出，因此才會請求身為鄰人（半同胞）的瑚太朗的支援。至於到底那是出於殘餘的母性還是魔物的本能，就不得而知了。
Q：瑚太朗的雙親及附近的鄰居對他身上發生的事情知道多少
A：雙親從Mater那裡能瞭解到大體的情況。在Mater的調查所及範圍內，瑚太朗與名為Guardian的危險組織有關聯這種程度的資訊應該已經被透露給他們。不過，即使他們知道Guardian的存在，但由於他們是Mater的會員及專任研究員，所以對他們而言那只是極少有機會接觸的遙遠世界的存在。天王寺夫妻雖然作為研究員在一定程度上接觸了更為核心的資訊，但並沒有作為魔物使參加過戰鬥，對其實態也不甚瞭解。所以應該僅僅有「兒子加入了不良少年集團」的豪華版的印象吧。順帶一提，瑚太朗與篝之間的情況除了小鳥之外沒有其他人知情。而關於瑚太朗成長停滯的理由，也只有「外傷性的腦機能障礙」這種程度的推測。此外，附近的鄰居中應該也有少部分人聽說了「天王寺家的兒子身體成長停滯，記憶也……」的傳聞吧。因此天王寺夫妻並不怎麼願意回到家中。這是由於很可能被鄰居們刨根問底地追問前述事件的情況，且這樣一來他們也不得不正視家庭瀕臨瓦解的事實。他們兩人或許有些怯懦，但對瑚太朗並非完全沒有愛情。
Q：如果所有路線的瑚太朗彙聚一堂，最強的是哪個瑚太朗？
A：當然Moon篇的瑚太朗由於開啟了作弊碼，完全成為了超越其他路線的存在，但其實個別路線的瑚太朗在潛在能力方面要比Terra篇瑚太朗更高。秘密就是被埋入瑚太朗體內的篝的AURORA（Miracle Ribon），它擁有匹敵普通人一生份的生命力。也就是說，瑚太朗的初期狀態擁有兩人份的生命力。在個別路線中也有著憑藉這點，通過拜師、極大地改變自身資質、不斷重複錯誤總結經驗，將力量完全發揮的描寫。而另一方面，Terra篇的瑚太朗沒有AURORA。一般狀態下的瑚太朗，從能力上來說只能算作平均值以下的超人。但取而代之的是他以接受軍事訓練及經歷實戰補充了才能的不足。所以比賽形式的正面對戰的話應該是個別路線的瑚太朗，而允許突襲的實戰的話則是Terra篇的瑚太朗更有利吧。
創作內容
【設定資料】《Rewrite》田中羅密歐對劇情＆設定完全解說
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