沙耶之歌是個不論在性愛場面或者整體劇情上都堪稱為R-18向的獵奇作品，加上詭異的CG圖及配音，讓整部作品更顯詭侷，強烈建議如果不能忍受獵奇向的玩家最好就別碰這部作品了，在這部作品裡面，「做愛」的涵義與一般大家常玩的Gal-Game是有些許不同的，這點在之後的劇情會有所透露。
遊戲一開始便有相關聲明，遊戲內主角所生的病與現實是毫無任何關係的，實際上也應該沒有這樣的病症，但是在遊戲當中，這樣的設定才有辦法形成這個遊戲裡面所發生的事情與世界觀。
畫面一開始便出現一團肉塊（異型）的圖案，同時，有著含糊不清的沙啞聲音出現，這個，便是主角──勾坂郁紀目前所看見的世界，據他本人的形容，是個「柔軟蠕動著的肉塊，用黏糊糊的聲音這樣說道」，同時，這樣的肉塊共有三個，圍繞在桌子旁邊，像是品茗一般的啜飲著杯中的污水。
這裡的字幕有部份是呈現亂碼的狀態，這是正常現象，因為郁紀必須認真聽才知道這些肉塊在說些什麼……然而，雖然郁紀看見的世界是如此的歪曲，但他也知道這些肉塊是他所謂的「朋友」，只是這樣的他已經無法再信任眼前的三個肉塊，同時為了隱藏自己在感官認知上的障礙，他一直故作自己是非常正常的一個人，至於為何郁紀的世界會變成這樣……？
原因該歸咎於先前所發生的一場車禍，而勾坂郁紀因此受了重傷，雖然利用了醫院最新的技術救回了一命，但眼前的世界卻徹底改變──一般人的形體變成了蠕動著的肉塊、原本的地面、牆壁全都有著溼滑的內臟與肉塊所覆蓋……常人在吃的東西，到了郁紀面前成了難以下嚥的污水，這，就是勾坂郁紀所處的世界。
但是，身為醫大生的他很清楚自己哪裡出了問題，所以一直裝作自己在術後的恢復十分正常，但也因此漸漸的與朋友──高富青海、津久叶瑤，以及戶尾耕司的關係變的疏遠，受不了眼中的肉塊找他對話的郁紀（肉塊蠕動著的纖毛，以及噴濺到臉上的惡臭汙水，讓郁紀差點止不住衝動想拿起椅子砸死這些肉塊），隨口附和了幾句便匆匆離開。
畫面切換回真實的模樣，實際上不過就是朋友們聚集在一起討論著冬季一同出遊去滑雪的事情，同時，身為郁紀最親近的友人──瑤，不禁有些羨慕與嫉妒眼前的情侶，也就是青海與耕司
可以這樣享受兩人互動的時光，而自己卻還沒跟郁紀在一起時，那場災難就先降臨於郁紀身上……她盡量掩飾自己內心的動搖，但是纖細的耕司似乎發現了瑤的情形，因此開口向郁紀詢問，然而，郁紀的態度卻讓人感到難以親近，夏天結束時所發生的那場意外，那道傷痕似乎仍深深影響了郁紀以及週遭的人──大型油罐車的翻覆事故，勾坂郁紀在那時便喪失了自己所有的親人，父母的屍體連辨識都顯得困難。
在郁紀離開咖啡廳之後，畫面轉到了術後負責診療郁紀的丹保涼子的診療室，對於這名醫生來說，這名青年可說是最為麻煩的患者，不論哪種對話，對於勾坂郁紀而言，他與人之間的障礙異常的巨大，回答時就像在自言自語……問了幾個慣例的問題之後，丹保涼子嘆了口氣：「勾坂先生……你在醫院所接受的是腦神經界最先進的治療。關於這點你也清楚吧。」
那是……利用機器將硬膜下的血塊加以去除，而且是僅有一家醫院可以做得到的技術，也唯有這個方法可以拯救腦部受到重大損害的勾坂郁紀的性命，然而，這樣的技術卻沒有其他數據可供參考，因此使得這項治療備具危險性。
然而，勾坂郁紀卻反問著丹保涼子上個禮拜關於腦部磁核共振的掃描結果，即便一切顯示正常──但丹保涼子身為醫生的第六感卻知道，這名患者的態度顯得異常，同時在他的背後，有著迫切的畏懼，或者痛苦。
但是勾坂郁紀卻沒有對丹保涼子提起任何異狀，如果是這樣就連醫生本人也無法進一步幫忙……倒是勾坂郁紀向醫生問了一個問題──一個關於名為奧涯教授的事情，那是圈外人絕對不會知道的人的名字，丹保涼子只得用笑容硬撐，同時反問郁紀：「奧涯教授的事情……跟你的治療沒有關係吧？」
面對郁紀像是在審問般的語氣，丹保涼子在郁紀的回問之後，才說自己跟這名教授沒有交流，而且他是很久以前就從這裡辭職的人。
只是，對於郁紀如此執著奧涯的這件事情，丹保感到好奇，而郁紀只說他最近認識了教授的家屬，正在託其調查教授失蹤的事情……然而丹保涼子卻感到疑惑，因為奧涯教授並沒有所謂的親屬，同時，她也叫郁紀請警察幫忙──即便這是危險的賭注，因為奧涯在這裡所做的一切全都是不能對外公開的。
然而，本以為會繼續堅持的勾坂郁紀卻退卻了，在資料上記載著「術後情況良好」的丹保涼子，本想提醒勾坂下次診療的時間，卻看見勾坂郁紀已經站起並離開了診療室。
看著四周都是由腐肉與內臟所組成的牆壁，郁紀知道那本來是一片白色的吧？而在走廊上竄過的肉塊實際上是「人」，為何能這樣冷靜的判斷，或許正因為自己也是專於腦神經科學的醫大生吧？因此他大致知道自己所患的疾病大概是失識症或其他未知的認識性障礙。
由於沒有治療的辦法，勾坂郁紀認知到自己只能去「習慣」眼前的場景，或許很困難吧！但他也只能終其一生的活下去。
這樣想著的他，為了不看到令人作嘔的場景，低著頭快步的往鄰近山腳的家裡走去。
──三個月前的事故，讓這間房子只剩他一個人居住，父親的公司由他人接手，因此房子只是做為遺產而遺留在這邊而已……只是，如果雙親還健在的話，對於自己和「身份不明的女性」同居的話肯定是不會允許的吧？
創作內容
沙耶の唄（含劇透，獵奇向慎入）－其之一
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