備註檔案
•本作的編劇加兩位畫師都有自己的代表神奇寶貝，日下的是頑皮彈、真斗的是走路草（後期還有蚊香蝌蚪跟火岩鼠）、山本的初期為呆呆獸，之後固定為吞食獸。
•特別篇的一大特色為會配合電玩的世代，讓該世代的神奇寶貝和絕招全在該世代的章節內至少出現過一遍。
◦例如第一章和第二章，就讓前151種神奇寶貝和第一世代的絕招都出現過，後面以此類推(註1)。
◦而其中幾章甚至預先讓下一世代的神奇寶貝或絕招搶先客串一下。
•各地區的歷代圖鑑持有人通常是由男主、男二、與女主（關都組則有兩位女主）所組成。
◦不過合眾組與卡洛斯組例外，合眾組是由兩位男主和兩位女主所組成，卡洛斯組目前則只有一對男女主。
◦總結男主有七人、女主有八人、男二有四人。
◦儘管男二通常代指第三人，不過若按版本分配，第三人中只有米拉特是男二，其他皆為女主（小藍、克麗絲、普蘭汀娜），若是將拉克茲當作第三人則男性有兩人。
•本作在分配給主角的御三家，主要依照草→火→水的順序下去循環。
◦例如男主：小智（草）→阿金（火）→路比（水）→戴亞（草）→布萊克（火）→拉克茲（水）等。
◦女主亦同（水→草→火），目前唯一的例外是懷茲（沒有御三家，但很有可能會成為火組），小洛則有皮卡丘。
◦男主的御三家屬性總是剋制女主，而女主的則剋制男二。
•目前為止特別篇中的主角群名稱皆是取自版本名，這與絕大多數遊戲中的主角內定名是不同的（但大多數版本名被設置為備用名）。
◦主角群版本名的分配通常是遊戲男主第一版本、男二第二版本、遊戲女主第三版本（資料片）。
◦沒有單一可更改名字的遊戲男二（勁敵）的情況下，女主遞補第二版本。
◾若是在有單一可更改名字的勁敵但版本已確定數目不足的情況下，也由女主優先使用第二版本名（目前僅黑2.白2篇為特例，各世代首作尚未發生過此情形）。
◦而若還有多餘的版本則採用原創角色。
•特別篇的封面幾乎都是以主角群為主，目前少數有上過封面的配角有亞希達、竹蘭、火箭隊四將軍、蘭木博士、黑連、白露、N、北尚、南廈、艾莉絲、阿修等 以及作為封面背景的赤焰松和水梧桐。
◦目前登上封面最多次的配角是N，一共登上四次(註2)，黑連和白露則各登上兩次。
◦歷代電玩封面獸目前僅鳳王和洛奇亞未曾上過封面被排擠了。
◦特別篇主角上封面幾乎都是穿著全套正裝（少數集數例外），並且封面封底必定會有神奇寶貝主題不可缺。
◾XY篇和ORAS篇先行本封底例外（不一定有神奇寶貝） 不過因為不是正式單行本，所以無所謂。
◦而封底則讓眾角色們都有平均的機會登上除了歷代博士外，好一點的甚至還有像「自行車人力店長」、「滿金收訊塔導播」這種跑龍套的配角也給他登上封底。
◦目前有登上封底兩次的有小智主角待遇、希巴和嘉德麗雅。
•特別篇每回的標題幾乎皆為「VS XXX」（XXX為神奇寶貝名稱）。
◦至第四章起增加副標題，因應遊戲要素，這些標語全為點字，並於每集卷末附上下集預告點字標語，而在該章節結束時，則會揭示點字標題的答案。點字標題一直沿用自第九章。
◦第三章則是於卷末使用未知圖騰文字「To Be Continued」。
◦其中第七章的副標題命名特色為「XX與XX」、第八章為「XX的XX」、第九章則是皆加了驚嘆號。
◦第五章是目前唯一以副標題作為主標題的章節（即沒有「VS XXX」的標題）。
◦第十章起副標題改以兩個字的漢字呈現，第十一章則改以兩個英文單字組成的片假名詞呈現。
◦XY篇先行本則使用了「神奇寶貝名稱+動詞」（多混雜單個漢字）的標題，以及ORAS篇使用「EPISODE 回數」作為標題。
•目前單行本一共收錄過三次彩圖，分別在20集、40集、和42集。20集和40集收錄的是人氣場景，42集收錄的是心金.魂銀篇的設定稿。
◦另外還有推出過兩本限定版27集和50集。27集是因應十週年紀念，並且附有十位圖鑑持有人集結的彩圖及實體相框，50集則是附有64頁的豪華彩圖集結本。
•在特別篇中，館主的戲分並不像動畫只是跑龍套的
，而是具有其重要的地位（
雖然有些仍略為影薄），甚至進而影響到原作，讓第五世代館主的戲分大為增加。
•特別篇亦逆流了不少設定回原作 例如袋龍的氣魄特性(註3)、怪力的腰帶(註4)、寶貝球的命中投射點、館主阿速與阿杏的配對、路莎放閃的橋段(註5)等 僅管原作並沒有特別關照特別篇。
•如同其他神奇寶貝作品的世界觀，特別篇大部分的人物都沒有姓氏，唯有少數的角色有公布其姓氏。目前公布過的姓氏有大木、空木、小田卷、山梨、紅豆杉、法桐（布拉塔諾）（博士）、曾根崎（正輝）、貝爾里慈（神奧名門）、卡貝娜（華依）、茲伏奇（大吾父子）、索藍斯（博士）、哈爾孟尼亞（N和魁奇思，末姓格羅皮烏斯）、布爾喬瓦（合眾名門）等。
◦其中法桐(註6)、貝爾里慈、卡貝娜、哈爾孟尼亞、和布爾喬瓦是西方姓氏。
◦庫庫伊博士與芭內特博士則無法確認是否為姓氏。
◦而部分角色的名字雖然看起來像姓氏，但其實卻是名，例如坂木 一切都是翻譯的陰謀（?）。
•神奇寶貝特別篇目前一共舉辦過兩次人氣投票，一次是在2005、一次是在2011。
◦第一屆主角群共有十位，第二屆則增為十五位。
◦第一屆以票選人物為主，第二屆增加神奇寶貝票選，另外亦有人氣場景票選。
•根據日下在推特所說，當初決定推出單行本時，因為皮皮傳已經使用「神奇寶貝」當書名，為了有所區別特別想了一些名字，其中還有「神奇寶貝G（Get）」、「神奇寶貝Z」XY等候選名，不過最後選擇使用「神奇寶貝特別篇」來當作品名稱。
•根據日下的原設定，三獸士原本設定為第二章渡的手下，分別是普通、飛行、和鋼系的高手，不過該方案後來取消了，之後三獸士被移植到第五章，成了火箭隊的幹部，其中只有查克拉完全保留了擅長鋼系這個特點。
•礙於各種原因，特別篇雖然有那商機，但從未推出過任何商業化周邊，官網上甚至有人問過有沒有小洛圖鑑持有人的商品。
◦不過特別篇官方倒是有自製一些贈品回饋給投稿回響的讀者，像是印有戴亞和帕爾圖案的筆（圖稿收錄於40集）、神奧三人組的手提袋、以及官網目前贈送的，布萊克、懷特、和N的手提袋、和雜誌的一些贈品等。
◦此外特別篇亦推出過真斗以特別篇人物做教學漫畫的特別企劃年代物，共有小智和小洛兩個版本，除此之外還有神奇寶貝同好俱樂部會長跟小霞四個人物登場。
註1 第三章為第二世代，第四、五、六章為第三世代，第七、八、九章為第四世代，第十、十一章為第五世代，第十二、十三章為第六世代，第十四章為第七世代。
註2 由於50集和51集被拆成各半登上封面，所以實際上是三次。
註3 在第二章菊子的回憶中，大木博士曾用袋龍使出迷昏拳打中耿鬼，迷昏拳為普通系絕招，照理來說打不到幽靈系的耿鬼，然而之後第三世代新增了特性設定，袋龍的特性氣魄讓牠可以打到幽靈系的神奇寶貝 只能說一切都是巧合。
註4 同樣是在第二章，希巴因應戰術考量讓怪力維持豪力時期壓制力量的腰帶，而原先遊戲中的怪力也沒有腰帶（第一、二世代僅有模糊疑似腰帶的圖像，第三世代則是完全沒有），然而從第四世代起怪力開始有了腰帶......（不過特別篇從第三世代開始即有先見之明讓怪力穿上腰帶，看來希巴那段是被視為黑歷史了。(註7))
註5 原作並未特別強調男女主角的曖昧關係 然而於重製版卻增加了令人遐想的閃光結尾。
註6 雖然也有當日本姓氏用的案例，例如漫畫「一起來玩神奇寶貝卡片遊戲吧～！XY」的博士 不過姓氏被竄改成了ウラターヌ（原為プラターヌ）。
註7 只能解釋為和進化無關，只是單純的怪力拿掉腰帶就能釋放全部力量了。
創作內容
神奇寶貝特別篇 備註檔案......
神奇寶貝 (4)